Le CENIR organise des cours à propos de l'imagerie RMN dans les neurosciences cognitives et clinique durant toute la première moitié de l'année 2009. Ils porteront sur l'intégralité du champ de connaissances du domaine : des bases physiologiques aux analyses informatiques possibles.

En règle générale, ces cours auront lieu chaque semaine, le lundi de 15h30 à 16h30, dans la salle de cours au rez-de-chaussée du bâtiment Chaslin.

Ci-dessous, le planning détaillé :

1- Repères anatomiques principaux sur l’IRM

5 janvier 2009 Christine Delmaire

Les sillons, les lobes, les commissures. Comment retrouver l’hémisphère gauche et l’hémisphère droit après 50 heures de traitement

2- Les formats d’images de l’acquisition au traitement

 12 janvier 2009 Romain Valabrègue

DICOM, formats Analyze et Nifti, IMA, IMG, header, fichier .mat, flip  comment retrouver les informations dans une image.

3- IRM fonctionnelle (partie 1 / 2)

19 janvier 2009 Romain Valabrègue

Bases physiologiques du contraste

Acquisition : résolution spatiale, rapport Signal sur Bruit, distorsions et artefacts 

26 janvier 2009 Eric Bardinet

Prétraitements : normalisation, coregistration, templates, lissage : techniques, principes

2 février 2009 Nathalie Georgre & Anne-Lise Paradis  

Paradigmes en bloc / paradigmes événementiels

9 février 2009 Mélanie Pelegrini

Modèles de détection des activations sur la base du Modèle Linéaire généralisé (SPM):

14 février au 1er mars Vacances scolaires 

2 mars 2009 Mathias Pessiglione

Modèles de détection des activations sur la base du Modèle Linéaire Généralisé (SPM):

analyses de 1er niveau.

9 mars 2009 Mathias Pessiglione 

Modèles de détection des activations sur la base du Modèle Linéaire Généralisé (SPM):

analyses de 2nd niveau.

16 mars 2009 Mélanie Pelegrini

Exploitation des résultats : le glass-brain, le tableau des voxels, les plots

4- Les réseaux

            23 mars 2009 Habib Benali

Vue d’ensemble

            30 mars 2009 Guillaume Marrelec

Description des réseaux

            6 avril 2009 Vincent Pelbar

NEDICA

11 avril au 26 avril Vacances scolaires

5- Analyse morphométrique (partie 1 / 2)

27 avril 2009 Olivier Coliot

Intérêt des études de morphométrie. Comment faire en pratique ?

6-IRM fonctionnelle (partie 2 / 2)

4 mai 2009 Romain Valabrègue

Batchs et SPM

7-TMS

11 mai 2009 Frédéric Bernard & Sabine Meunier

Applications de la TMS en sciences cognitives

8- Analyse morphométrique (partie 2 / 2)  

18 mai 2009 Eric Bardinet & Christine Delmaire

VBM : principes et application, quelles statistiques pour quelles études (modulation ou non, covariables : SG, volume intra cranien, séquence) ? 

9- Imagerie du tenseur de diffusion (partie 1 / 2)

25 mai 2009 Stéphane Lehéricy

Bases physiques et acquisition

2 juin 2009 (Attention c’est un mardi, de 14h30 à 16h30) Michel Thibault

Prétraitement des données :

Guide pratique des DICOM à la première dissection

(Récupérer les gradients, FSL eddy current corrections, le modèle de tenseur, la dissection du corps calleux, les limites)

C'est un cours interactif, il est conseillé de venir avec son ordinateur portable et le logiciel TrackVis.

Comment faire des études de groupes ?

L'approche hodologique anatomique

Hodologie versus Topologie, les limites de la VB-DTI, extraire les chiffres issus de la tractographie pour faire des statistiques de groupe,  analyser et  interpréter, quelques exemples de la littérature

            8 juin 2009 Maxime Descoteaux

Les modèles : HARDI, Q Ball, Riemannian.

15 juin 2009 Maxime Descoteaux

Tractographie

10- Techniques de corrélation anatomico-fonctionnelle

 22 juin 2009 Emmanuelle Volle

Comment faire des études sur des cerveaux lésés ?

11- Imagerie du tenseur de diffusion  (partie 2 / 2)

29/06 Christine Delmaire & Stéphane Lehéricy

VBM/TBSS